Первое упоминание о с.Дегунино относится к 1339г. в духовной грамоте вел.кн.Иоанна Даниловича Калиты. Первое упоминание о деревянном храме относится к 1585 г. Во время польско-литовской интервенции храм сгорел, затем в 1633 г. на старом месте был построен вновь деревянный храм. В 1761-62 гг. на месте обветшавшего храма был вновь выстроен однопрестольный деревянный храм.
В 1863 г. по благословению свт.Филарета Московского началось строительство нового каменного храма с приделами во имя Божией Матери "Всех скорбящих Радость" и свт.Николая. Освящение храма состоялось в 1866 г. Храм закрыт 25 февраля 1941 г. После закрытия храма здание переоборудовали под амбулаторию и до 1990 г. его использовали для технических целей различный организации, планомерно разрушая, несмотря на то, что в 1961 году здание храма причислено к памятникам архитектуры и выдан охранный договор. В июле 1990 года зарегистрирована православная община и началось возрожение разрушенного храма. Богослужения возобновлены с 8 октября 1991 года.